APOL2

APOL2
معرفات
أسماء بديلة	APOL2, APOL-II, APOL3, apolipoprotein L2
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607252 MGI: MGI:2444921 HomoloGene: 12785 GeneCards: 23780
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• signaling receptor binding; • lipid binding; • high-density lipoprotein particle binding;
مكونات خلوية	• سيتوبلازم; • الفراغ خارج الخلية; • endoplasmic reticulum membrane; • غشاء;
عمليات حيوية	• نمو متعدد الخلايا; • lipoprotein metabolic process; • lipid transport; • cholesterol metabolic process; • acute-phase response; • maternal process involved in female pregnancy; • أيض الليبيدات; • GO:0015915 نقل;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q9BQE5
	n/a
	NM_145637، XM_011530077، XM_047441284، XM_047441285 NM_030882، NM_145637، XM_011530077، XM_047441284، XM_047441285
	XM_006520932، XM_006520934، XM_006520936، XM_006520937، XM_006520938، XM_006520939، XM_011245619، NM_001357895، NM_001357896، XM_030248553، XM_030248554، XR_003951388، XR_003951389، XR_003951390 NM_001081970، XM_006520932، XM_006520934، XM_006520936، XM_006520937، XM_006520938، XM_006520939، XM_011245619، NM_001357895، NM_001357896، XM_030248553، XM_030248554، XR_003951388، XR_003951389، XR_003951390
	NP_663612، XP_011528376، XP_011528377، XP_011528378، XP_011528379، XP_011528380، XP_016884213 NP_112092، NP_663612، XP_011528376، XP_011528377، XP_011528378، XP_011528379، XP_011528380، XP_016884213
	n/a
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

APOL2‏ (Apolipoprotein L2) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين APOL2 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

هذا الجين عضو في عائلة جينات أبوليبوبروتين إل، والبروتينات في هذه العائلة هي بروتينات رابط للدهون. يُشفّر هذا الجين بروتينًا بوزن 37.1 كيلو دالتون، ويحتوي تسلسله البروتيني على 337 زوجًا قاعديًا. يوجد هذا البروتين بشكل رئيسي في السيتوزول والنواة، بالإضافة إلى ذلك، يُرى أيضًا في الأجسام النووية.^[4] قد يؤثر دور هذا الجين في حركة الدهون وارتباطها بالعضيات. وقد عُثر على نسختين مختلفتين تُشفّران نفس البروتين لهذا الجين.^[3]

تسلسل الأحماض الأمينية

MNPESSIFIE DYLKYFQDQV SRENLLQLLT DDEAWNGFVA AAELPRDEAD ELRKALNKLA SHMVMKDKNR HDKDQQHRQW FLKEFPRLKR ELEDHIRKLR ALAEEVEQVH RGTTIANVVS NSVGTTSGIL TLLGLGLAPF TEGISFVLLD TGMGLGAAAA VAGITCSVVE LVNKLRARAQ ARNLDQSGTN VAKVMKEFVG GNTPNVLTLV DNWYQVTQGI GRNIRAIRRA RANPQLGAYA PPPHVIGRIS AEGGEQVERV VEGPAQAMSR GTMIVGAATG GILLLLDVVS LAYESKHLLE GAKSESAEEL KKRAQELEGK LNFLTKIHEM LQPGQDQ^[5]^[6]

إجمالي الأحماض الأمينية: 337^[5]

التفاعل

ثبت أن APOL2 يتفاعل مع:

الوصل البديل

يحتوي ApoL2 على 5 متغيرات وصل،^[4]

APOL2-001

تحتوي هذه النسخة على 6 إكسونات، و12 نطاقًا وسمات مُعلّقة، و263 تباينًا مرتبطًا بهذا الجين، وتُطابق 35 مسبارًا قليلًا.

APOL2-002

تحتوي هذه النسخة على 5 إكسونات، و12 نطاقًا وسمات مُعلّقة، و263 تباينًا مرتبطًا بهذا الجين، وتُطابق 37 مسبارًا قليلًا.

APOL2-006

تحتوي هذه النسخة على 6 إكسونات، وتُطابق 3 نطاقات وسمات، و62 تباينًا مرتبطًا بهذا الجين، وتُطابق 20 مسبارًا قليلًا.

APOL2-008

تحتوي هذه النسخة على 6 إكسونات، و12 نطاقًا وسمات مُعلّقة، و331 تباينًا مرتبطًا بهذا الجين، وتُطابق 32 مسبارًا قليلًا.

APOL2-009

تحتوي هذه النسخة على 5 إكسونات، و4 مجالات، وخصائص مُعلّقة. 104 تباينات مرتبطة بهذا الجين، وتُطابق 13 مسبارًا أوليغو.

وظائف ApoL2

الاستجابة للالتهاب الحاد^[11]^[12]
عملية أيض الكوليسترول^[13]
عملية أيض الدهون^[10]
العملية الأمومية المرتبطة بحمل الأنثى^[14]
ارتباط الدهون^[15]
ارتباط مستقبلات الإشارة^[15]
الشيخوخة^[16]

المراجع

^ Dunham I، Shimizu N، Roe BA، Chissoe S، Hunt AR، Collins JE، Bruskiewich R، Beare DM، Clamp M، Smink LJ، Ainscough R، Almeida JP، Babbage A، Bagguley C، Bailey J، Barlow K، Bates KN، Beasley O، Bird CP، Blakey S، Bridgeman AM، Buck D، Burgess J، Burrill WD، O'Brien KP، وآخرون (ديسمبر 1999). "The DNA sequence of human chromosome 22". Nature. ج. 402 ع. 6761: 489–95. DOI:10.1038/990031. PMID:10591208.
^ "Entrez Gene: APOL2 apolipoprotein L, 2". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ ^ا ^ب Page NM، Butlin DJ، Lomthaisong K، Lowry PJ (مايو 2001). "The human apolipoprotein L gene cluster: identification, classification, and sites of distribution". Genomics. ج. 74 ع. 1: 71–8. DOI:10.1006/geno.2001.6534. PMID:11374903.
^ ^ا ^ب "The Human Protein atlas Gene: APOL2 apolipoprotein L, 2". مؤرشف من الأصل في 2019-04-19.
^ ^ا ^ب "UniProt". www.uniprot.org. مؤرشف من الأصل في 2024-11-04. اطلع عليه بتاريخ 2024-02-06.
^ Ultsch, Mark; Holliday, Michael J.; Gerhardy, Stefan; Moran, Paul; Scales, Suzie J.; Gupta, Nidhi; Oltrabella, Francesca; Chiu, Cecilia; Fairbrother, Wayne; Eigenbrot, Charles; Kirchhofer, Daniel (27 Jul 2021). "Structures of the ApoL1 and ApoL2 N-terminal domains reveal a non-classical four-helix bundle motif". Communications Biology (بالإنجليزية). 4 (1): 916. DOI:10.1038/s42003-021-02387-5. ISSN:2399-3642. PMC:8316464. PMID:34316015.
^ Liao W، Goh FY، Betts RJ، Kemeny DM، Tam J، Bay BH، Wong WS (فبراير 2011). "A novel anti-apoptotic role for apolipoprotein L2 in IFN-gamma-induced cytotoxicity in human bronchial epithelial cells". J Cell Physiol. ج. 226 ع. 2: 397–406. DOI:10.1002/jcp.22345. PMID:20665705. S2CID:27845807.
^ Bruening J، Lasswitz L، Banse P، Kahl S، Marinach C، Vondran FW، Kaderali L، Silvie O، Pietschmann T، Meissner F، Gerold G (يوليو 2018). "Hepatitis C virus enters liver cells using the CD81 receptor complex proteins calpain-5 and CBLB". PLOS Pathogens. ج. 14 ع. 7: 55–67. DOI:10.1371/journal.ppat.1007111. PMC:6053247. PMID:30024968. مؤرشف من الأصل في 2019-04-28.
^ Smith EE، Malik HS (مايو 2009). "The apolipoprotein L family of programmed cell death and immunity genes rapidly evolved in primates at discrete sites of host-pathogen interactions". Genome Res. ج. 19 ع. 5: 850–8. DOI:10.1101/gr.085647.108. PMC:2675973. PMID:19299565.
^ ^ا ^ب Liu Z، Lu H، Jiang Z، Pastuszyn A، Hu CA (يناير 2005). "Apolipoprotein L6, a Novel Proapoptotic Bcl-2 Homology 3–Only Protein, Induces Mitochondria-Mediated Apoptosis in Cancer Cells". Mol Cancer Res. ج. 3 ع. 1: 21–31. DOI:10.1158/1541-7786.21.3.1. PMID:15671246. S2CID:2545675.
^ Rao SK، Pavicevic Z، Du Z، Kim JG، Fan M، Jiao Y، Rosebush M، Samant S، Gu W، Pfeffer LM، Nosrat CA (أكتوبر 2010). "Pro-inflammatory genes as biomarkers and therapeutic targets in oral squamous cell carcinoma". J Biol Chem. ج. 285 ع. 42: 32512–21. DOI:10.1074/jbc.M110.150490. PMC:2952253. PMID:20702412.
^ Liu Z، Lu H، Jiang Z، Pastuszyn A، Hu CA (أكتوبر 2013). "Mitochondrial proteomic analysis of human host cells infected with H3N2 swine influenza virus". J Proteomics. ج. 8 ع. 91: 136–50. DOI:10.1016/j.jprot.2013.06.037. PMID:23856606.
^ Wang K، Edmondson AC، Li M، Gao F، Qasim AN، Devaney JM، Burnett MS، Waterworth DM، Mooser V، Grant SF، Epstein SE، Reilly MP، Hakonarson H، Rader DJ (يوليو 2011). "Pathway-Wide Association Study Implicates Multiple Sterol Transport and Metabolism Genes in HDL Cholesterol Regulation". Frontiers in Genetics. ج. 2 ع. 4: 41. DOI:10.3389/fgene.2011.00041. PMC:3268595. PMID:22303337.
^ Brosens JJ، Hodgetts A، Feroze-Zaidi F، Sherwin JR، Fusi L، Salker MS، Higham J، Rose GL، Kajihara T، Young SL، Lessey BA، Henriet P، Langford PR، Fazleabas AT (أبريل 2010). "Proteomic analysis of endometrium from fertile and infertile patients suggests a role for apolipoprotein A-I in embryo implantation failure and endometriosis". MHR: Basic Science of Reproductive Medicine. ج. 16 ع. 4: 273–285. DOI:10.1093/molehr/gap108. PMC:2834406. PMID:20008415.
^ ^ا ^ب "Nextprot Gene: APOL2 apolipoprotein L, 2". مؤرشف من الأصل في 2024-06-05.
^ Luo، Audrey؛ Jung، Jeesun؛ Longley، Martha؛ Rosoff، Daniel B.؛ Charlet، Katrin؛ Muench، Christine؛ Lee، Jisoo؛ Hodgkinson، Colin A.؛ Goldman، David؛ Horvath، Steve؛ Kaminsky، Zachary A.؛ Lohoff، Falk W. (2020). "Epigenetic aging is accelerated in alcohol use disorder and regulated by genetic variation in APOL2". Neuropsychopharmacology. ج. 45 ع. 2: 327–336. DOI:10.1038/s41386-019-0500-y. PMC:6901591. PMID:31466081.

قراءة متعمقة

McGhee KA، Morris DW، Schwaiger S (2005). "Investigation of the apolipoprotein-L (APOL) gene family and schizophrenia using a novel DNA pooling strategy for public database SNPs". Schizophr. Res. ج. 76 ع. 2–3: 231–8. DOI:10.1016/j.schres.2005.01.006. PMID:15949655.
Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
Monajemi H، Fontijn RD، Pannekoek H، Horrevoets AJ (2002). "The apolipoprotein L gene cluster has emerged recently in evolution and is expressed in human vascular tissue". Genomics. ج. 79 ع. 4: 539–46. DOI:10.1006/geno.2002.6729. PMID:11944986.
Duchateau PN، Pullinger CR، Cho MH (2001). "Apolipoprotein L gene family: tissue-specific expression, splicing, promoter regions; discovery of a new gene". J. Lipid Res. ج. 42 ع. 4: 620–30. PMID:11290834.
Adams MD، Kerlavage AR، Fleischmann RD (1995). "Initial assessment of human gene diversity and expression patterns based upon 83 million nucleotides of cDNA sequence" (PDF). Nature. ج. 377 ع. 6547 Suppl: 3–174. PMID:7566098. مؤرشف من الأصل (PDF) في 2024-07-08.

[1] Dunham I، Shimizu N، Roe BA، Chissoe S، Hunt AR، Collins JE، Bruskiewich R، Beare DM، Clamp M، Smink LJ، Ainscough R، Almeida JP، Babbage A، Bagguley C، Bailey J، Barlow K، Bates KN، Beasley O، Bird CP، Blakey S، Bridgeman AM، Buck D، Burgess J، Burrill WD، O'Brien KP، وآخرون (ديسمبر 1999). "The DNA sequence of human chromosome 22". Nature. ج. 402 ع. 6761: 489–95. DOI:10.1038/990031. PMID:10591208.

[2] "Entrez Gene: APOL2 apolipoprotein L, 2". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[:0-3] ا ^ب Page NM، Butlin DJ، Lomthaisong K، Lowry PJ (مايو 2001). "The human apolipoprotein L gene cluster: identification, classification, and sites of distribution". Genomics. ج. 74 ع. 1: 71–8. DOI:10.1006/geno.2001.6534. PMID:11374903.

[Protein_Location-4] ا ^ب "The Human Protein atlas Gene: APOL2 apolipoprotein L, 2". مؤرشف من الأصل في 2019-04-19.

[:02-5] ا ^ب "UniProt". www.uniprot.org. مؤرشف من الأصل في 2024-11-04. اطلع عليه بتاريخ 2024-02-06.

[6] Ultsch, Mark; Holliday, Michael J.; Gerhardy, Stefan; Moran, Paul; Scales, Suzie J.; Gupta, Nidhi; Oltrabella, Francesca; Chiu, Cecilia; Fairbrother, Wayne; Eigenbrot, Charles; Kirchhofer, Daniel (27 Jul 2021). "Structures of the ApoL1 and ApoL2 N-terminal domains reveal a non-classical four-helix bundle motif". Communications Biology (بالإنجليزية). 4 (1): 916. DOI:10.1038/s42003-021-02387-5. ISSN:2399-3642. PMC:8316464. PMID:34316015.

[pmid20665705-7] Liao W، Goh FY، Betts RJ، Kemeny DM، Tam J، Bay BH، Wong WS (فبراير 2011). "A novel anti-apoptotic role for apolipoprotein L2 in IFN-gamma-induced cytotoxicity in human bronchial epithelial cells". J Cell Physiol. ج. 226 ع. 2: 397–406. DOI:10.1002/jcp.22345. PMID:20665705. S2CID:27845807.

[pmid30024968-8] Bruening J، Lasswitz L، Banse P، Kahl S، Marinach C، Vondran FW، Kaderali L، Silvie O، Pietschmann T، Meissner F، Gerold G (يوليو 2018). "Hepatitis C virus enters liver cells using the CD81 receptor complex proteins calpain-5 and CBLB". PLOS Pathogens. ج. 14 ع. 7: 55–67. DOI:10.1371/journal.ppat.1007111. PMC:6053247. PMID:30024968. مؤرشف من الأصل في 2019-04-28.

[pmid19299565-9] Smith EE، Malik HS (مايو 2009). "The apolipoprotein L family of programmed cell death and immunity genes rapidly evolved in primates at discrete sites of host-pathogen interactions". Genome Res. ج. 19 ع. 5: 850–8. DOI:10.1101/gr.085647.108. PMC:2675973. PMID:19299565.

[pmid15671246-10] ا ^ب Liu Z، Lu H، Jiang Z، Pastuszyn A، Hu CA (يناير 2005). "Apolipoprotein L6, a Novel Proapoptotic Bcl-2 Homology 3–Only Protein, Induces Mitochondria-Mediated Apoptosis in Cancer Cells". Mol Cancer Res. ج. 3 ع. 1: 21–31. DOI:10.1158/1541-7786.21.3.1. PMID:15671246. S2CID:2545675.

[pmid20702412-11] Rao SK، Pavicevic Z، Du Z، Kim JG، Fan M، Jiao Y، Rosebush M، Samant S، Gu W، Pfeffer LM، Nosrat CA (أكتوبر 2010). "Pro-inflammatory genes as biomarkers and therapeutic targets in oral squamous cell carcinoma". J Biol Chem. ج. 285 ع. 42: 32512–21. DOI:10.1074/jbc.M110.150490. PMC:2952253. PMID:20702412.

[pmid238566062-12] Liu Z، Lu H، Jiang Z، Pastuszyn A، Hu CA (أكتوبر 2013). "Mitochondrial proteomic analysis of human host cells infected with H3N2 swine influenza virus". J Proteomics. ج. 8 ع. 91: 136–50. DOI:10.1016/j.jprot.2013.06.037. PMID:23856606.

[pmid22303337-13] Wang K، Edmondson AC، Li M، Gao F، Qasim AN، Devaney JM، Burnett MS، Waterworth DM، Mooser V، Grant SF، Epstein SE، Reilly MP، Hakonarson H، Rader DJ (يوليو 2011). "Pathway-Wide Association Study Implicates Multiple Sterol Transport and Metabolism Genes in HDL Cholesterol Regulation". Frontiers in Genetics. ج. 2 ع. 4: 41. DOI:10.3389/fgene.2011.00041. PMC:3268595. PMID:22303337.

[pmid20008415-14] Brosens JJ، Hodgetts A، Feroze-Zaidi F، Sherwin JR، Fusi L، Salker MS، Higham J، Rose GL، Kajihara T، Young SL، Lessey BA، Henriet P، Langford PR، Fazleabas AT (أبريل 2010). "Proteomic analysis of endometrium from fertile and infertile patients suggests a role for apolipoprotein A-I in embryo implantation failure and endometriosis". MHR: Basic Science of Reproductive Medicine. ج. 16 ع. 4: 273–285. DOI:10.1093/molehr/gap108. PMC:2834406. PMID:20008415.

[Go_Biological_Process-15] ا ^ب "Nextprot Gene: APOL2 apolipoprotein L, 2". مؤرشف من الأصل في 2024-06-05.

[16] Luo، Audrey؛ Jung، Jeesun؛ Longley، Martha؛ Rosoff، Daniel B.؛ Charlet، Katrin؛ Muench، Christine؛ Lee، Jisoo؛ Hodgkinson، Colin A.؛ Goldman، David؛ Horvath، Steve؛ Kaminsky، Zachary A.؛ Lohoff، Falk W. (2020). "Epigenetic aging is accelerated in alcohol use disorder and regulated by genetic variation in APOL2". Neuropsychopharmacology. ج. 45 ع. 2: 327–336. DOI:10.1038/s41386-019-0500-y. PMC:6901591. PMID:31466081.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 607252
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000489186 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1412486