Open Tree of Life
Open Tree of Life là một cây phát sinh sự sống trực tuyến – một nỗ lực hợp tác của nhiều nhà khoa học, được tài trợ bởi Quỹ Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. Bản thảo đầu tiên của website bao gồm 2,3 triệu loài, đã được phát hành vào tháng 9 năm 2015. Biểu đồ tương tác cho phép người dùng phóng to các bậc phân loại, xem xét các nhánh phát sinh loài và các thông tin liên quan. Khi nhấp vào một loài, website sẽ trả về nguồn và phân loại tham chiếu của loài đó.
| Có sẵn bằng | tiếng Anh |
|---|---|
| Website | opentreeoflife.org |
| Thương mại | không |
| Yêu cầu đăng ký | không bắt buộc |
| Bắt đầu hoạt động | 9/2015 |
| Tình trạng hiện tại | Hoạt động |
Giấy phép nội dung | BSD 2-clause (FreeBSD)[1] |
Open Tree of Life là một cây phát sinh sự sống trực tuyến – một nỗ lực hợp tác của nhiều nhà khoa học, được tài trợ bởi Quỹ Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ.[2][3] Bản thảo đầu tiên của website bao gồm 2,3 triệu loài, đã được phát hành vào tháng 9 năm 2015.[4] Biểu đồ tương tác cho phép người dùng phóng to các bậc phân loại, xem xét các nhánh phát sinh loài và các thông tin liên quan. Khi nhấp vào một loài, website sẽ trả về nguồn và phân loại tham chiếu của loài đó.
Phương pháp xây dựng
[sửa | sửa mã nguồn]Dự án sử dụng phương pháp supertree để xây dựng một cây phát sinh loài duy nhất (được cung cấp tại tree.opentreeoflife.org[5]) từ một tập hợp các nghiên cứu khoa học về phát sinh loài đã công bố và được chọn lọc.
Cây phát sinh này là sự kết hợp của nhiều kết quả phân loại của các dự án lớn khác; được tổng hợp ra bằng một phần mềm có tên là "smasher".[6] Kết quả phân loại này được gọi là Open Tree Taxonomy (OTT) và có thể truy cập trực tuyến.[7]
Lịch sử
[sửa | sửa mã nguồn]Dự án được khởi động vào tháng 6 năm 2012 với giải thưởng Quỹ Khoa học Quốc gia ba năm dành cho các nhà nghiên cứu tại mười trường đại học. Năm 2015, một giải thưởng bổ sung hai năm đã được trao cho các nhà nghiên cứu tại ba tổ chức.
Xem thêm
[sửa | sửa mã nguồn]Tham khảo
[sửa | sửa mã nguồn]- ^ "OpenTreeOfLife License".
- ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM, và đồng nghiệp (tháng 10 năm 2015). "Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (41): 12764–9. Bibcode:2015PNAS..11212764H. doi:10.1073/pnas.1423041112. PMC 4611642. PMID 26385966.
- ^ "Assembling, Visualizing, and Analyzing the Tree of Life". National Science Foundation (NSF). ngày 11 tháng 3 năm 2011. Truy cập ngày 11 tháng 2 năm 2016.
- ^ Pennisi E (ngày 21 tháng 9 năm 2015). "First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species". Science Magazine.
- ^ "opentree". Open Tree of Life developers.
- ^ Rees JA, Cranston K (2017). "Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis". Biodiversity Data Journal. 5 (5): e12581. doi:10.3897/BDJ.5.e12581. PMC 5515096. PMID 28765728.
- ^ "tree.opentreeoflife.org".