NAMD
Nanoscale Molecular Dynamics (NAMD, önceden Not Another Molecular Dynamics Program), Charm ++ paralel programlama modeli kullanılarak yazılmış moleküler dinamik simülasyonu yazılımıdır . Paralel verimliliği ile ön plandadır ve genellikle büyük sistemleri (milyonlarca atom) simüle etmek için kullanılır. University of Illinois at Urbana–Champaign'nde Teorik ve Hesaplamalı Biyofizik Grubu (TCB) ve Paralel Programlama Laboratuvarı (PPL) işbirliği ile geliştirilmiştir. NAMD, ticari olmayan amaçlar için ücretsiz olarak mevcuttur.
| Geliştirici | University of Illinois at Urbana–Champaign: Teorik ve Hesaplamalı Biyofizik Grubu (Theoretical and Computational Biophysics Group/TCB), Paralel Programlama Labaratuvarı (Parallel Programming Laboratory/PPL) |
|---|---|
| İlk yayınlanma | 1995) |
| Kod deposu | |
| Programlama dili | C++ |
| İşletim sistemi | Çapraz platform: Windows, Linux, macOS, Unix |
| Platform | x86, x86-64 |
| Diller | İngilizce |
| Tür | Moleküler dinamik similasyon |
| Resmî sitesi | ks.uiuc.edu/Research/namd |
Nanoscale Molecular Dynamics (NAMD, önceden Not Another Molecular Dynamics Program),[1] Charm ++ paralel programlama modeli kullanılarak yazılmış moleküler dinamik simülasyonu yazılımıdır . Paralel verimliliği ile ön plandadır ve genellikle büyük sistemleri (milyonlarca atom) simüle etmek için kullanılır.[2] University of Illinois at Urbana–Champaign'nde Teorik ve Hesaplamalı Biyofizik Grubu (TCB) ve Paralel Programlama Laboratuvarı (PPL) işbirliği ile geliştirilmiştir.
NAMD, ticari olmayan amaçlar için ücretsiz olarak mevcuttur.
Ayrıca bakınız
[değiştir | kaynağı değiştir]- Charm ++
- Moleküler mekanik modelleme yazılımları karşılaştırması
- Ücretsiz ve açık kaynaklı yazılım paketlerinin listesi
Kaynakça
[değiştir | kaynağı değiştir]- ^ "Flexibility and Interoperability in a Parallel Molecular Dynamics Code". 17 Mayıs 2018 tarihinde kaynağından (postscript) arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Mart 2020.
- ^ "NAMD A Parallel Object-Oriented Molecular Dynamics Program" (PDF). 9 Ekim 2006 tarihinde kaynağından (PDF) arşivlendi. Erişim tarihi: 14 Mart 2020.
Dış bağlantılar
[değiştir | kaynağı değiştir]- Resmî site,
- NAMD page at the PPL website5 Ocak 2007 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.
- NAMD on GPUs13 Mart 2012 tarihinde Wayback Machine sitesinde arşivlendi.