TOP2B

Топоизомераза ДНК 2-бета — фермент, кодируемый у человека геном TOP2B. Этот ген кодирует ДНК топоизомеразу, фермент, который контролирует и изменяет топологические состояния ДНК во время транскрипции. Этот ядерный фермент участвует в процессах, таких как конденсация хромосом, хроматидное разделение и снижение торсионного напряжения, которое происходит во время транскрипции ДНК и репликации. Он катализирует переходной взлом и воссоединение двух нитей дуплексной ДНК, позволяя нитям пройти сквозь друг друга, изменяя таким образом топологию ДНК. Две формы этого фермента существуют как вероятные продукты в случае дупликации генов. Ген, кодирующий форму бета, локализуется на хромосоме 3, а форму альфа —локализуется на хромосоме 17. Ген, кодирующий этот фермент функционирует в качестве цели для нескольких противоопухолевых агентов, например митоксантрона, и множество мутаций в этом гене связаны с развитием лекарственной устойчивости. Снижение активности этого фермента может также играть роль в атаксии-телеангиэктазии . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскриптов; однако второй вариант ещё не полностью описан.

Топоизомераза (ДНК) II бета 180kDa
Человеческая топоизомераза Iibeta в комплексе с ДНК (золотая сфера). PDB entry 4j3n
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 3QX3, 4G0U, 4G0V, 4G0W, 4J3N
Идентификаторы
Символ	TOP2B ; TOPIIB; top2beta
Внешние ID	OMIM: 126431 MGI: 98791 HomoloGene: 134711 ChEMBL: 3396 GeneCards: Ген TOP2B
номер EC	5.99.1.3
Генная онтология Функция • chromatin binding • DNA topoisomerase type II (ATP-hydrolyzing) activity • protein kinase C binding • ATP binding • protein C-terminus binding • DNA binding, bending • enzyme binding • histone deacetylase binding • metal ion binding • protein heterodimerization activity Компонент клетки • heterochromatin • nucleus • nucleoplasm • nucleolus • cytoplasm • cytosol • nucleoid • DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing) Биологический процесс • resolution of meiotic recombination intermediates • sister chromatid segregation • neuron migration • ATP catabolic process • DNA topological change • DNA unwinding involved in DNA replication • mitotic recombination • axonogenesis • forebrain development • mitotic DNA integrity checkpoint Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	7155	21974
Ensembl	ENSG00000077097	ENSMUSG00000017485
UniProt	Q02880	Q64511
RefSeq (мРНК)	NM_001068	NM_009409
RefSeq (белок)	NP_001059	NP_033435
Локус (UCSC)	Chr 3: 25.64 – 25.71 Mb	Chr 14: 16.37 – 16.43 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

Топоизомераза ДНК 2-бета — фермент, кодируемый у человека геном TOP2B^[1][2].

Этот ген кодирует ДНК топоизомеразу, фермент, который контролирует и изменяет топологические состояния ДНК во время транскрипции. Этот ядерный фермент участвует в процессах, таких как конденсация хромосом, хроматидное разделение и снижение торсионного напряжения, которое происходит во время транскрипции ДНК и репликации. Он катализирует переходной взлом и воссоединение двух нитей дуплексной ДНК, позволяя нитям пройти сквозь друг друга, изменяя таким образом топологию ДНК. Две формы этого фермента существуют как вероятные продукты в случае дупликации генов. Ген, кодирующий форму бета, локализуется на хромосоме 3, а форму альфа —локализуется на хромосоме 17. Ген, кодирующий этот фермент функционирует в качестве цели для нескольких противоопухолевых агентов, например митоксантрона, и множество мутаций в этом гене связаны с развитием лекарственной устойчивости. Снижение активности этого фермента может также играть роль в атаксии-телеангиэктазии^[англ.] . Альтернативный сплайсинг этого гена приводит к двум вариантам транскриптов; однако второй вариант ещё не полностью описан^[3].

Взаимодействия

[править | править код]

TOP2B, как было выявлено, взаимодействуют с BAZ1B^[4], HDAC1^[5][6], гистондеацетилазой 2^[5], CD3E^[7], SUMO1^{[англ.][8]} и P53^[9].

Примечания

[править | править код]

1. ↑ Tan K.B., Dorman T.E., Falls K.M., Chung T.D., Mirabelli C.K., Crooke S.T., Mao J. Topoisomerase II alpha and topoisomerase II beta genes: characterization and mapping to human chromosomes 17 and 3, respectively (англ.) // Cancer Research^[англ.] : journal. — 1992. — January (vol. 52, no. 1). — P. 231—234. — PMID 1309226.
2. ↑ Jenkins J.R., Ayton P., Jones T., Davies S.L., Simmons D.L., Harris A.L., Sheer D., Hickson I.D. Isolation of cDNA clones encoding the beta isozyme of human DNA topoisomerase II and localisation of the gene to chromosome 3p24 (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 1993. — January (vol. 20, no. 21). — P. 5587—5592. — doi:10.1093/nar/20.21.5587. — PMID 1333583. — PMC 334390.
3. ↑ Entrez Gene: TOP2B topoisomerase (DNA) II beta 180kDa .
4. ↑ Kitagawa, Hirochika; Fujiki Ryoji, Yoshimura Kimihiro, Mezaki Yoshihiro, Uematsu Yoshikatsu, Matsui Daisuke, Ogawa Satoko, Unno Kiyoe, Okubo Mataichi, Tokita Akifumi, Nakagawa Takeya, Ito Takashi, Ishimi Yukio, Nagasawa Hiromichi, Matsumoto Toshio, Yanagisawa Junn, Kato Shigeaki. The chromatin-remodeling complex WINAC targets a nuclear receptor to promoters and is impaired in Williams syndrome (англ.) // Cell : journal. — United States: Cell Press, 2003. — June (vol. 113, no. 7). — P. 905—917. — ISSN 0092-8674. — doi:10.1016/S0092-8674(03)00436-7. — PMID 12837248.
5. ↑ ^{1 2} Tsai, S C; Valkov N; Yang W M; Gump J; Sullivan D; Seto E. Histone deacetylase interacts directly with DNA topoisomerase II (англ.) // Nature Genetics : journal. — UNITED STATES, 2000. — November (vol. 26, no. 3). — P. 349—353. — ISSN 1061-4036. — doi:10.1038/81671. — PMID 11062478.
6. ↑ Johnson, C A; Padget K; Austin C A; Turner B M. Deacetylase activity associates with topoisomerase II and is necessary for etoposide-induced apoptosis (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — United States, 2001. — February (vol. 276, no. 7). — P. 4539—4542. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.C000824200. — PMID 11136718.
7. ↑ Nakano, H; Yamazaki T; Miyatake S; Nozaki N; Kikuchi A; Saito T. Specific interaction of topoisomerase II beta and the CD3 epsilon chain of the T cell receptor complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 1996. — March (vol. 271, no. 11). — P. 6483—6489. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.271.11.6483. — PMID 8626450.
8. ↑ Mao, Y; Desai S D; Liu L F. SUMO-1 conjugation to human DNA topoisomerase II isozymes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — UNITED STATES, 2000. — August (vol. 275, no. 34). — P. 26066—26073. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M001831200. — PMID 10862613.
9. ↑ Cowell, I G; Okorokov A L; Cutts S A; Padget K; Bell M; Milner J; Austin C A. Human topoisomerase IIalpha and IIbeta interact with the C-terminal region of p53 (англ.) // Experimental Cell Research^[англ.] : journal. — UNITED STATES, 2000. — February (vol. 255, no. 1). — P. 86—94. — ISSN 0014-4827. — doi:10.1006/excr.1999.4772. — PMID 10666337.

Литература

[править | править код]

• Champoux J.J. DNA topoisomerases: structure, function, and mechanism. (англ.) // Annual Review of Biochemistry^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 70. — P. 369—413. — doi:10.1146/annurev.biochem.70.1.369. — PMID 11395412.
• Austin C.A., Fisher L.M. Isolation and characterization of a human cDNA clone encoding a novel DNA topoisomerase II homologue from HeLa cells. (англ.) // FEBS Letters^[англ.] : journal. — 1990. — Vol. 266, no. 1—2. — P. 115—117. — doi:10.1016/0014-5793(90)81520-X. — PMID 2163884.
• Chung T.D., Drake F.H., Tan K.B., et al. Characterization and immunological identification of cDNA clones encoding two human DNA topoisomerase II isozymes (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1990. — Vol. 86, no. 23. — P. 9431—9435. — doi:10.1073/pnas.86.23.9431. — PMID 2556712. — PMC 298510.
• Austin C.A., Sng J.H., Patel S., Fisher L.M. Novel HeLa topoisomerase II is the II beta isoform: complete coding sequence and homology with other type II topoisomerases (англ.) // Biochimica et Biophysica Acta^[англ.] : journal. — 1993. — Vol. 1172, no. 3. — P. 283—291. — doi:10.1016/0167-4781(93)90215-Y. — PMID 8383537.
• Davies S.L., Jenkins J.R., Hickson I.D. Human cells express two differentially spliced forms of topoisomerase II beta mRNA (англ.) // Nucleic Acids Research : journal. — 1993. — Vol. 21, no. 16. — P. 3719—3723. — doi:10.1093/nar/21.16.3719. — PMID 8396237. — PMC 309874.
• Nakano H., Yamazaki T., Miyatake S., et al. Specific interaction of topoisomerase II beta and the CD3 epsilon chain of the T cell receptor complex (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1996. — Vol. 271, no. 11. — P. 6483—6489. — doi:10.1074/jbc.271.11.6483. — PMID 8626450.
• Biersack H., Jensen S., Gromova I., et al. Active heterodimers are formed from human DNA topoisomerase II alpha and II beta isoforms (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1996. — Vol. 93, no. 16. — P. 8288—8293. — doi:10.1073/pnas.93.16.8288. — PMID 8710863. — PMC 38663.
• Meyer K.N., Kjeldsen E., Straub T., et al. Cell cycle-coupled relocation of types I and II topoisomerases and modulation of catalytic enzyme activities (англ.) // Journal of Cell Biology^[англ.] : journal. — 1997. — Vol. 136, no. 4. — P. 775—788. — doi:10.1083/jcb.136.4.775. — PMID 9049244. — PMC 2132491.
• Fukunaga R., Hunter T. MNK1, a new MAP kinase-activated protein kinase, isolated by a novel expression screening method for identifying protein kinase substrates (англ.) // The EMBO Journal : journal. — 1997. — Vol. 16, no. 8. — P. 1921—1933. — doi:10.1093/emboj/16.8.1921. — PMID 9155018. — PMC 1169795.
• Ng S.W., Liu Y., Schnipper L.E. Cloning and characterization of the 5'-flanking sequence for the human DNA topoisomerase II beta gene (англ.) // Gene : journal. — 1998. — Vol. 203, no. 2. — P. 113—119. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00500-3. — PMID 9426241.
• Yamane K., Kawabata M., Tsuruo T. A DNA-topoisomerase-II-binding protein with eight repeating regions similar to DNA-repair enzymes and to a cell-cycle regulator (англ.) // FEBS Journal^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 250, no. 3. — P. 794—799. — doi:10.1111/j.1432-1033.1997.00794.x. — PMID 9461304.
• Cowell I.G., Willmore E., Chalton D., et al. Nuclear distribution of human DNA topoisomerase IIbeta: a nuclear targeting signal resides in the 116-residue C-terminal tail (англ.) // Experimental Cell Research^[англ.] : journal. — 1998. — Vol. 243, no. 2. — P. 232—240. — doi:10.1006/excr.1998.4150. — PMID 9743583.
• Lang A.J., Mirski S.E., Cummings H.J., et al. Structural organization of the human TOP2A and TOP2B genes (англ.) // Gene : journal. — 1998. — Vol. 221, no. 2. — P. 255—266. — doi:10.1016/S0378-1119(98)00468-5. — PMID 9795238.
• Sng J.H., Heaton V.J., Bell M., et al. Molecular cloning and characterization of the human topoisomerase IIalpha and IIbeta genes: evidence for isoform evolution through gene duplication (англ.) // Biochimica et Biophysica Acta^[англ.] : journal. — 1999. — Vol. 1444, no. 3. — P. 395—406. — doi:10.1016/S0167-4781(99)00020-2. — PMID 10095062.
• Bjergbaek L., Jensen S., Westergaard O., Andersen A.H. Using a biochemical approach to identify the primary dimerization regions in human DNA topoisomerase IIalpha (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 37. — P. 26529—26536. — doi:10.1074/jbc.274.37.26529. — PMID 10473615.
• Cowell I.G., Okorokov A.L., Cutts S.A., et al. Human topoisomerase IIalpha and IIbeta interact with the C-terminal region of p53 (англ.) // Experimental Cell Research^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 255, no. 1. — P. 86—94. — doi:10.1006/excr.1999.4772. — PMID 10666337.
• Mao Y., Desai S.D., Liu L.F. SUMO-1 conjugation to human DNA topoisomerase II isozymes (англ.) // Journal of Biological Chemistry : journal. — 2000. — Vol. 275, no. 34. — P. 26066—26073. — doi:10.1074/jbc.M001831200. — PMID 10862613.
• Mirski S.E., Voskoglou-Nomikos T., Young L.C., et al. Simultaneous quantitation of topoisomerase II alpha and beta isoform mRNAs in lung tumor cells and normal and malignant lung tissue (англ.) // Laboratory Investigation^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 80, no. 6. — P. 787—795. — doi:10.1038/labinvest.3780083. — PMID 10879730.