MAFFT
MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos. MAFFT foi desenvolvida com maior velocidade para obter alinhamento múltiplo de sequências e, para tal, transformadas rápidas de Fourier foram usadas no procedimento. MAFFT está disponível gratuitamente para uso acadêmico, sem qualquer garantia.
| MAFFT | |
|---|---|
| Desenvolvedor | Kazutaka Katoh |
| Lançamento estável | 6.850
/ 6 de março de 2011 |
| Escrito em | C |
| Sistema operacional | UNIX, Linux, Mac, MS-Windows |
| Tipo | Bioinformática |
| Licença | Livre para usuários acadêmicos |
| Website | website |
MAFFT é um software para Alinhamento múltiplo de sequências para sequências de aminoácidos ou nucleótidos.[1][2] MAFFT foi desenvolvida com maior velocidade para obter alinhamento múltiplo de sequências e, para tal, transformadas rápidas de Fourier foram usadas no procedimento.[3] MAFFT está disponível gratuitamente para uso acadêmico, sem qualquer garantia.[4]
Ver também
[editar | editar código]- Clustal
- PHYLIP
- MEGA, Molecular Evolutionary Genetics Analysis
- PAUP
- T-Coffee
- MUSCLE
- Bioinformática
- Filogenética computacional
- Alinhamento múltiplo de sequências
Ligações externas
[editar | editar código]- Sítio oficial
- Servidos online MAFFT
- Servidor MAFFT na EBI
- ClustalW / MAFFT / PRRN na GenomeNet
- ClustalW / TCoffee / MAFFT no MyHits, SIB
Referências
- ↑ Katoh, Kazutaka; Misawa, Kazuharu; Kuma, Kei-ichi; Miyata, Takashi (2002). «MAFFT: a novel method for rapid multiple sequence alignment based on fast Fourier transform». Nucleic Acids Research. 30 (14). p. 3059–66. PMC 135756
. PMID 12136088. doi:10.1093/nar/gkf436
- ↑ Katoh, Kazutaka; Kuma, Kei-ichi; Toh, Hiroyuki; Miyata, Takashi (2005). «MAFFT version 5: improvement in accuracy of multiple sequence alignment». Nucleic Acids Research. 33 (2). p. 511–8. PMC 548345. PMID 15661851. doi:10.1093/nar/gki198
- ↑ Sharma, Kal Rengannathan (2009). Bioinformatics. Sequence Alignment and Markov Models (em inglês). New York: McGraw Hill. p. 122. ISBN 978-0-07-159306-9
- ↑ licença MAFFT