RDBP

Il fattore di elongazione negativo E (Negative elongation factor E - NELFE) è una proteina codificata nell'uomo dal gene RDBP.^[1]

Funzione

La proteina codificata da questo gene fa parte di un complesso nominato fattore di elongazione negativo (NELF), la cui funzione è reprimere la RNA polimerasi II dall'allungare i trascritti di RNA. Questa proteina ha una certa similarità con le proteine di ancoraggio all'RNA nucleare (nuclear RNA-binding proteins); tuttavia non è ancora stato dimostrato che questa proteina nello specifico leghi l'RNA. NELFE contiene una regione di alternanza di residui acidi e basici, in particolare di arginina (D) e acido aspartico (R). Il gene colloca il complesso maggiore di istocompatibilità (MHC) di tipo III sul cromosoma numero 6.

Interazioni

RDBPmostra una qualche interazione con:

Cofattore di BRCA1,^[2]
TH1L^[3]^[4]
WHSC2^[4].

Note

^ Entrez Gene: RDBP RD RNA binding protein, su ncbi.nlm.nih.gov.
^ Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM, Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region, in Genomics, vol. 83, n. 1, Gen 2004, pp. 153-67, DOI:10.1016/s0888-7543(03)00235-0, PMID 14667819.
^ Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D, Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry, in Molecular Systems Biology, vol. 3, 2007, p. 89, DOI:10.1038/msb4100134, PMID 17353931.
^ ^a ^b Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H, Human transcription elongation factor NELF: identification of novel subunits and reconstitution of the functionally active complex, in Molecular and Cellular Biology, vol. 23, n. 6, Mar 2003, pp. 1863-73, DOI:10.1128/mcb.23.6.1863-1873.2003, PMID 12612062.

Collegamenti esterni

NELFe, su v1.factorbook.org, FactorBook.

[entrez-1] Entrez Gene: RDBP RD RNA binding protein, su ncbi.nlm.nih.gov.

[pmid14667819-2] Lehner B, Semple JI, Brown SE, Counsell D, Campbell RD, Sanderson CM, Analysis of a high-throughput yeast two-hybrid system and its use to predict the function of intracellular proteins encoded within the human MHC class III region, in Genomics, vol. 83, n. 1, Gen 2004, pp. 153-67, DOI:10.1016/s0888-7543(03)00235-0, PMID 14667819.

[pmid17353931-3] Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D, Large-scale mapping of human protein-protein interactions by mass spectrometry, in Molecular Systems Biology, vol. 3, 2007, p. 89, DOI:10.1038/msb4100134, PMID 17353931.

[pmid12612062-4] Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H, Human transcription elongation factor NELF: identification of novel subunits and reconstitution of the functionally active complex, in Molecular and Cellular Biology, vol. 23, n. 6, Mar 2003, pp. 1863-73, DOI:10.1128/mcb.23.6.1863-1873.2003, PMID 12612062.

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